কনফরমেশনাল এনট্রপির ক্ষতি হল প্রোটিন ভাঁজ করার তাপগতিবিদ্যায় একটি প্রধান অবদান তবে, পরিমাণের সঠিক নির্ণয় চ্যালেঞ্জিং প্রমাণিত হয়েছে। আমরা নেটিভ প্রোটিন এবং একটি বাস্তবসম্মত বিকৃত রাষ্ট্রের সমাহার উভয়ের আণবিক গতিশীল সিমুলেশন ব্যবহার করে এই ক্ষতি গণনা করি।
কনফরমেশনাল এনট্রপি প্রোটিন কি?
কনফরমেশনাল এনট্রপি হল একটি অণুর কনফর্মেশনের সংখ্যার সাথে যুক্ত এনট্রপি। … প্রোটিনে, ব্যাকবোন ডিহেড্রাল অ্যাঙ্গেল এবং সাইড চেইন রোটামারগুলি সাধারণত প্যারামিটার হিসাবে ব্যবহৃত হয় এবং আরএনএ-তে বেস পেয়ারিং প্যাটার্ন ব্যবহার করা যেতে পারে।
কোনটির গঠনগত এনট্রপি একটি ভাঁজ করা প্রোটিন বা একটি উন্মোচিত প্রোটিন আছে?
পলিপেপটাইড চেইনের কনফরমেশনাল এনট্রপি আনফোল্ড স্টেট এর জন্য আরও কম্প্যাক্ট ভাঁজ করা অবস্থার তুলনায় অনেক বেশি সীমাবদ্ধ কনফরমেশনাল স্পেসের বৈশিষ্ট্যযুক্ত। অতএব, এই অবদান উন্মোচিত অবস্থাকে স্থিতিশীল করে (ΔSconf > 0)।
প্রোটিনের গঠন কী নির্ধারণ করে এবং প্রোটিন ভাঁজ করার সমস্যা কী?
একটি প্রোটিনের প্রাথমিক গঠন, এর রৈখিক অ্যামিনো-অ্যাসিড ক্রম, এর স্থানীয় গঠন নির্ধারণ করে। নির্দিষ্ট অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ এবং পলিপেপটাইড শৃঙ্খলে তাদের অবস্থান নির্ধারণকারী কারণগুলির জন্য প্রোটিনের অংশগুলি একত্রে ঘনিষ্ঠভাবে ভাঁজ করে এবং এর ত্রিমাত্রিক রূপ গঠন করে।
কোন বিষয়গুলো প্রোটিনের ভাঁজকে প্রভাবিত করে?
প্রোটিন ভাঁজ একটি অত্যন্ত সংবেদনশীল প্রক্রিয়া যা বৈদ্যুতিক এবং চৌম্বক ক্ষেত্র, তাপমাত্রা, pH, রাসায়নিক, স্থান সীমাবদ্ধতা এবং আণবিক ভিড় সহ বিভিন্ন বাহ্যিক কারণ দ্বারা প্রভাবিত হয়।এই কারণগুলি প্রোটিনগুলিকে তাদের সঠিক কার্যকরী ফর্মগুলিতে ভাঁজ করার ক্ষমতাকে প্রভাবিত করে৷
