সমস্ত অ্যামিনো অ্যাসিড α-হেলিসে পাওয়া যায়, কিন্তু গ্লাইসিন এবং প্রোলিন অস্বাভাবিক, কারণ তারা α-হেলিক্সকে অস্থিতিশীল করে। গ্লাইসিন অনেক স্টেরিক সীমাবদ্ধতা থেকে অব্যাহতি পেয়েছে কারণ এতে β কার্বন নেই। … অন্যদিকে প্রোলিন খুবই অনমনীয়৷
আলফা হেলিসে কোন অ্যামিনো অ্যাসিড পাওয়া যায় না?
Proline প্রোটিনের আলফা হেলিকাল গঠনে পাওয়া যায় না, কারণ এটির বিশেষ চক্রীয় গঠন রয়েছে (এটি একটি ইমিনো অ্যাসিড নয় অ্যামিনো অ্যাসিড) এই ধরনের গৌণ কাঠামোতে নির্দিষ্ট প্রস্থ এবং নির্দিষ্ট সংখ্যক অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ / পালা। তাই প্রোলিনকে আলফা হেলিকাল ব্রেকার হিসেবে বিবেচনা করা হয়।
গ্লাইসিন একটি আলফা হেলিক্স ব্রেকার কেন?
প্রোলিন এবং গ্লাইসিন কখনও কখনও "হেলিক্স ব্রেকার" হিসাবে পরিচিত হয় কারণ তারা α হেলিকাল ব্যাকবোন গঠনের নিয়মিততা ব্যাহত করে; যাইহোক, উভয়েরই অস্বাভাবিক গঠনগত ক্ষমতা রয়েছে এবং সাধারণত পালাক্রমে পাওয়া যায়।
আলফা হেলিক্সে গ্লাইসিন কোথায় থাকে?
হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্স মোটিফে তিনটি পজিশন রয়েছে যেগুলো অত্যন্ত সংরক্ষিত। একটি অ্যালানাইন সাধারণত প্রথম α হেলিক্সের মধ্যে 5 অবস্থানে পাওয়া যায়; একটি গ্লাইসিন পাওয়া যায় পজিশন 9, মোড়ের প্রথম অবস্থানে; এবং ভ্যালাইন বা আইসোলিউসিন সাধারণত দ্বিতীয় α হেলিক্সের মধ্যে 15 অবস্থানে পাওয়া যায়।
গ্লাইসিনের অবশিষ্টাংশ কি মূলত আলফা হেলিসে পাওয়া যায়?
Glycine, এর অনেক সম্ভাব্য প্রধান চেইন কনফর্মেশন সহ, এছাড়াও খুব কমই হেলিসে পাওয়া যায়। একটি আলফা হেলিক্সে (তথাকথিত হেলিক্স প্রবণতা) অ্যামিনো অ্যাসিড হওয়ার সম্ভাবনা কতটা তা জেনে, প্রোটিন ক্রমানুসারে হেলিক্স কোথায় ঘটবে তা ভবিষ্যদ্বাণী করা সম্ভব৷
