কেন একাধিক ক্রম প্রান্তিককরণ?

2024 লেখক: Fiona Howard | [email protected]. সর্বশেষ পরিবর্তিত: 2024-01-10 06:34

মাল্টিপল সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট জোড়া সারিবদ্ধকরণের চেয়ে বেশি তথ্য প্রদান করে যেহেতু তারা প্রোটিন পরিবারের মধ্যে সংরক্ষিত অঞ্চলগুলি দেখায় যা কাঠামোগত এবং কার্যকরী গুরুত্বের।

একটি মাল্টিপল সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট পরিচালনার উদ্দেশ্য কী?

জৈবিক ক্রমগুলির একটি সেট (RNA, প্রোটিন, DNA) দেওয়া, একটি MSA পদ্ধতির উদ্দেশ্য হল ক্রমগুলিকে এমনভাবে সারিবদ্ধ করা যা হয় তাদের বিবর্তনীয়, কার্যকরী বা কাঠামোগত সম্পর্ককে প্রতিফলিত করবে(চিত্র 1)।

কীভাবে একাধিক সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট বিবর্তনে সাহায্য করে?

সংযুক্ত ক্রমগুলি অনেক উদ্দেশ্যে ব্যবহার করা হয়, যার মধ্যে রয়েছে অনুমানিক বিচ্যুতির ধরণ, নির্বাচন, বিবর্তনীয় পরিবর্তনের গতি এবং মোড, কার্যকরী উপাদান এবং সীমাবদ্ধতার সনাক্তকরণ এবং ফাইলোজেনেটিক ইতিহাস, শুধু কয়েকটি নাম।

একাধিক সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট কি?

মাল্টিপল সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট (MSA) হল সাধারণত একই দৈর্ঘ্যের তিন বা ততোধিক জৈবিক সিকোয়েন্সের (প্রোটিন বা নিউক্লিক অ্যাসিড) সারিবদ্ধতা আউটপুট থেকে, হোমোলজি অনুমান করা যেতে পারে এবং অধ্যয়ন করা ক্রমগুলির মধ্যে বিবর্তনীয় সম্পর্ক। … খুব দ্রুত MSA টুল যা স্থানীয় অঞ্চলগুলিতে মনোনিবেশ করে৷

কীভাবে একাধিক সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট তৈরি হয়?

ক্লাস্টাল ওমেগা অ্যালগরিদম একটি মাল্টিপল সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট তৈরি করে প্রথমে কে-টুপল মেথড ব্যবহার করে পেয়ারওয়াইজ অ্যালাইনমেন্ট তৈরি করে তারপর, mBed পদ্ধতি ব্যবহার করে সিকোয়েন্সগুলো ক্লাস্টার করা হয়। এটি k-মানে ক্লাস্টারিং পদ্ধতি অনুসরণ করে। গাইড ট্রি পরবর্তীতে UPGMA পদ্ধতি ব্যবহার করে নির্মিত হয়।