Logo bn.boatexistence.com

বিগউইগ ফাইল কি?

সুচিপত্র:

বিগউইগ ফাইল কি?
বিগউইগ ফাইল কি?

ভিডিও: বিগউইগ ফাইল কি?

ভিডিও: বিগউইগ ফাইল কি?
ভিডিও: আইজিভিতে ভিজ্যুয়ালাইজেশনের জন্য পিক ফাইলগুলিকে বিগউইগে রূপান্তর করা হচ্ছে 2024, জুন
Anonim

BigWig হল একটি জিনোম ব্রাউজার ট্র্যাকে ঘন, অবিচ্ছিন্ন ডেটা প্রদর্শনের জন্য একটি ফাইল ফর্ম্যাট, Wiggle (WIG) ফর্ম্যাট থেকে রূপান্তর দ্বারা তৈরি৷ বিগউইগ ফরম্যাট ইউসিএসসি জিনোম বায়োইনফরমেটিক্স ওয়েব সাইটে বর্ণনা করা হয়েছে, এবং ব্রড ইনস্টিটিউট ফাইল ফরম্যাট গাইড অতিরিক্ত তথ্য প্রদান করে।

বিগউইগ ফরম্যাট কি?

বিগউইগ ফরম্যাট হল ঘন, অবিচ্ছিন্ন ডেটা প্রদর্শনের জন্য যা একটি গ্রাফ হিসাবে প্রদর্শিত হবে BigWig ফাইলগুলি WIG টাইপ ফাইলগুলি থেকে প্রাথমিকভাবে UCSC প্রোগ্রাম wigToBigWig ব্যবহার করে তৈরি করা হয়। বিকল্পভাবে, UCSC প্রোগ্রাম bedGraphToBigWig ব্যবহার করে বেডগ্রাফ ফাইল থেকে বিগউইগ ফাইল তৈরি করা যেতে পারে।

আমি কিভাবে bigWig ফাইল ব্যবহার করব?

নতুন তৈরি করা বিগউইগ ফাইলটি সরান (myBigWig.bw) একটি ওয়েব-অ্যাক্সেসযোগ্য http, https, বা ftp অবস্থানে। কাস্টম ট্র্যাক এন্ট্রি ফর্মে URL পেস্ট করুন বা একটি একক ট্র্যাক লাইন ব্যবহার করে একটি কাস্টম ট্র্যাক তৈরি করুন৷ কাস্টম ট্র্যাক পরিচালনা পৃষ্ঠার পাঠ্য বাক্সে কাস্টম ট্র্যাক লাইনটি আটকান৷

একটি BigWig ট্র্যাক কি?

bigWig ট্র্যাক হল সমগ্র জিনোম জুড়ে ক্রমাগত সংকেতের জন্য ট্র্যাক। এগুলি বিভিন্ন "কাঁচা" পরীক্ষার ফলাফল যেমন ChIP-Seq সংকেত, RNA-Seq সংকেত ইত্যাদি প্রদর্শনের জন্য উপযুক্ত৷

আমি কিভাবে একটি বড় উইগ ফাইল তৈরি করব?

বিগউইগ ফাইল তৈরি করার একাধিক উপায় আছে। এটি সাধারণত একটি রূপান্তর জড়িত। bam ফাইলটি একটি wiggle Track (. wig) এবং তারপর wiggle Trackটিকে একটি বাইনারি বিগউইগে রূপান্তর করা হচ্ছে (.

প্রস্তাবিত: