SDS দৃঢ়ভাবে আবদ্ধ হয় ধনাত্মক চার্জযুক্ত এবং এর সালফেট গ্রুপ এবং অ্যালকাইল চেইনের মাধ্যমে প্রোটিনের হাইড্রোফোবিক অবশিষ্টাংশ , যথাক্রমে13 তদনুসারে, এটি কাঠামোগত জীববিজ্ঞান এবং প্রোটিন ভাঁজ/উন্মোচন গবেষণার ক্ষেত্রে একটি মূল্যবান ডিটারজেন্ট।
এসডিএস প্রোটিনের ক্ষেত্রে কী করে?
SDS একটি অ্যাম্ফিপ্যাথিক সার্ফ্যাক্ট্যান্ট। এটি হাইড্রোকার্বন লেজের সাথে প্রোটিন শৃঙ্খলে আবদ্ধ হয়ে প্রোটিনকে যুক্ত করে, সাধারণত সমাহিত অঞ্চলগুলিকে উন্মুক্ত করে এবং প্রোটিন চেইনকে সার্ফ্যাক্ট্যান্ট অণুর সাথে আবরণ করে। এসডিএসের পোলার হেড গ্রুপ এই ডিনাচুরেন্ট ব্যবহারে একটি অতিরিক্ত সুবিধা যোগ করে।
এসডিএস কীভাবে অ্যামিনো অ্যাসিডের সাথে আবদ্ধ হয়?
এসডিএসের একটি হাইড্রোফোবিক লেজ রয়েছে যা প্রোটিন (পলিপেপটাইড) চেইনের সাথে দৃঢ়ভাবে যোগাযোগ করে।প্রোটিনের সাথে আবদ্ধ হওয়া SDS অণুর সংখ্যা অ্যামিনো অ্যাসিডের সংখ্যার সমানুপাতিক যা প্রোটিন তৈরি করে প্রতিটি SDS অণু দুটি ঋণাত্মক চার্জে অবদান রাখে, প্রোটিনের যেকোনো চার্জকে অপ্রতিরোধ্য করে।
এসডিএস কি প্রোটিনকে আবৃত করে?
SDS এছাড়াও একটি অভিন্ন ঋণাত্মক চার্জ দিয়ে প্রোটিনকে আবৃত করে, যা R-গ্রুপের অন্তর্নিহিত চার্জগুলিকে মুখোশ করে। SDS রৈখিক প্রোটিনগুলির সাথে মোটামুটি সমানভাবে আবদ্ধ হয় (প্রায় 1.4g SDS/ 1g প্রোটিন), যার অর্থ এই যে প্রোটিনের চার্জ এখন তার আণবিক ওজনের প্রায় সমানুপাতিক৷
এসডিএস কীভাবে প্রোটিনকে ঋণাত্মক চার্জ দেয়?
SDS হল একটি ডিটারজেন্ট যাতে একটি দীর্ঘ আলিফ্যাটিক চেইন এবং একটি সালফেট গ্রুপ থাকে। এই ডিটারজেন্ট বিকৃত প্রোটিন এর সাথে মিথস্ক্রিয়া করে একটি শক্তিশালীভাবে ঋণাত্মক চার্জযুক্ত কমপ্লেক্স তৈরি করে (SO42 থেকে উদ্ভূত ঋণাত্মক চার্জ − SDS এর গ্রুপ)। প্রোটিনগুলি প্রথমে তাপ দ্বারা বিকৃত হয় এবং তারপরে অতিরিক্ত পরিমাণে SDS যোগ করা হয়।
