6. নিষ্ক্রিয় হাইড্রোফোবিক: গ্লাইসিন, অ্যালানাইন, ভ্যালাইন, লিউসিন এবং আইসোলিউসিন সহ। এই অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি প্রোটিনের অভ্যন্তরে সমাহিত হওয়ার সম্ভাবনা বেশি। তাদের R গ্রুপ হাইড্রোজেন বন্ড গঠন করে না এবং খুব কমই রাসায়নিক বিক্রিয়ায় অংশগ্রহণ করে।
কোন অ্যামিনো অ্যাসিড হাইড্রোজেন বন্ড গঠন করতে পারে?
অ্যামিনো অ্যাসিড অ্যাসপারাজিন এবং গ্লুটামিন তাদের পাশের চেইনে অ্যামাইড গ্রুপ থাকে যা সাধারণত হাইড্রোজেন-বন্ধন থাকে যখনই তারা প্রোটিনের অভ্যন্তরে থাকে।
কোন অবশিষ্টাংশ হাইড্রোজেন বন্ড গঠন করতে পারে?
অনেক সংখ্যক অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ রয়েছে যেগুলি তাদের পেপটাইড গ্রুপ ছাড়াও পার্শ্ব চেইনের মাধ্যমে এইচ-বন্ড গঠন করতে পারে। সম্ভবত এই ক্যাটাগরির মধ্যে সবচেয়ে উল্লেখযোগ্য হল সাইড চেইন যাতে রয়েছে একটি হাইড্রোক্সিল (Ser এবং Thr) বা অ্যামাইড (Asn এবং Gln) গ্রুপ বা চার্জযুক্ত অবশিষ্টাংশ যেমন Lys, Arg, Asp এবং Glu।
অ্যামিনো কি হাইড্রোজেন বন্ড গঠন করতে পারে?
হাইড্রোফিলিক অ্যামিনো অ্যাসিডের অক্সিজেন এবং নাইট্রোজেন পরমাণু রয়েছে, যা জল এর সাথে হাইড্রোজেন বন্ধন তৈরি করতে পারে। এই পরমাণুগুলির ইলেকট্রনের অসম বন্টন রয়েছে, একটি মেরু অণু তৈরি করে যা জলের সাথে যোগাযোগ করতে পারে এবং হাইড্রোজেন বন্ধন তৈরি করতে পারে৷
কোন অ্যামিনো অ্যাসিড সম্ভবত হাইড্রোজেন বন্ডে অংশগ্রহণ করবে?
এই অ্যামিনো অ্যাসিড কি হাইড্রোজেন বন্ধন, আয়নিক বন্ধন, হাইড্রোফোবিক মিথস্ক্রিয়া এবং/অথবা ডিসালফাইড বন্ডে অংশগ্রহণ করার সম্ভাবনা বেশি? কেন? সেরিন দেখানো হয়েছে। হাইড্রোজেন বন্ধন।
