হোমোলজি মডেলিং টেমপ্লেট এবং টার্গেট সিকোয়েন্সের মধ্যে সাদৃশ্যের উপর ভিত্তি করে একটি লক্ষ্য প্রোটিনের ত্রিমাত্রিক গঠন অর্জন করে এবং এই কৌশলটি কার্যকর প্রমাণিত হয় যখন এটি মেমব্রেন প্রোটিন অধ্যয়নের ক্ষেত্রে আসে GPCR-এর মতো স্ফটিক করা কঠিন কারণ এটি … এর উচ্চতর ডিগ্রী উপলব্ধি করে
হোমোলজি মডেলিং কি এবং কেন এটি প্রয়োজন?
1.2.
হোমোলজি মডেলিং হল নির্ভরযোগ্য স্ট্রাকচারাল মডেল তৈরি করার জন্য সবচেয়ে নির্ভুল গণনা পদ্ধতি এবং এটি সাধারণত অনেক জৈবিক প্রয়োগে ব্যবহৃত হয়। হোমোলজি মডেলিং টেমপ্লেট প্রোটিনের সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্টের মাধ্যমে একটি কোয়েরি প্রোটিনের 3D কাঠামোর পূর্বাভাস দেয়।
হোমোলজি মডেলিংয়ের নীতি কী?
হোমোলজি মডেলিং তুলনামূলক মডেলিং নামেও পরিচিত যা পরিচিত কাঠামোর সাথে সিকোয়েন্স হোমোলজির উপর ভিত্তি করে প্রোটিন কাঠামোর পূর্বাভাস দেয়। এটি এই নীতির উপর ভিত্তি করে তৈরি করা হয়েছে যে " যদি দুটি প্রোটিন একটি উচ্চ পর্যাপ্ত ক্রম সাদৃশ্য ভাগ করে, তবে তাদের ত্রিমাত্রিক কাঠামো খুব একই রকম হতে পারে। "
কী একটি ভালো হোমোলজি মডেলিং করে?
যদি আমরা পরীক্ষামূলক কাঠামো থেকে <=2 Å rmsd সহ একটি "অত্যন্ত সফল হোমোলজি মডেল" সংজ্ঞায়িত করি, তাহলে টেমপ্লেটটিতে অবশ্যই >=60% সাফল্যের লক্ষ্যের সাথে সিকোয়েন্স আইডেন্টিটি থাকতে হবে হার >70% এমনকি উচ্চ সিকোয়েন্স আইডেন্টিটি (60%-95%), দশটি হোমোলজি মডেলের মধ্যে একটির একটি rmsd >5 Å বনাম
নিচের কোনটি হোমোলজি মডেলিং সম্পর্কে সত্য?
ব্যাখ্যা: নাম অনুসারে, হোমোলজি মডেলিং পরিচিত কাঠামোর সাথে সিকোয়েন্স হোমোলজির উপর ভিত্তি করে প্রোটিন কাঠামোর পূর্বাভাস দেয় হোমোলজি মডেলিং টেমপ্লেট প্রোটিনের সাথে সারিবদ্ধতার উপর ভিত্তি করে একটি সর্ব-পরমাণু মডেল তৈরি করে।… সারিবদ্ধকরণ ধাপে করা ত্রুটিগুলি নিম্নলিখিত মডেলিং ধাপে সংশোধন করা যাবে না।
